Package: ciecl 1.0.0

Rodolfo Tasso Suazo

ciecl: International Classification of Diseases 'ICD-10'/'ICD-11' for Chile

Tools for working with the International Classification of Diseases ('ICD-10' Chile official 'MINSAL'/'DEIS' v2018). Includes optimized 'SQL' search with 'SQLite', fuzzy matching of medical terms ('Jaro-Winkler'), Charlson and Elixhauser comorbidity calculation, 'WHO' 'ICD-11' 'API' integration, and hierarchical code validation. Data from Centro FIC Chile 'DEIS' <https://deis.minsal.cl/centrofic/>.

Authors:Rodolfo Tasso Suazo [aut, cre], Francisca Jofre [ctb], Maëlle Salmon [rev], Yanina Bellini [rev]

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ciecl_1.0.0.tgz(r-4.6-emscripten)
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DESCRIPTION |NEWS
card.svg |card.png
ciecl/json (API)

# Install 'ciecl' in R:
install.packages('ciecl', repos = c('https://packages.ropensci.org', 'https://cloud.r-project.org'))

Reviews:rOpenSci Software Review #765

Bug tracker:https://github.com/ropensci/ciecl/issues

Pkgdown/docs site:https://docs.ropensci.org

Datasets:
  • cie10_cl - Dataset CIE-10 Chile oficial MINSAL/DEIS v2018

On CRAN:

Conda:

5.62 score 5 stars 390 downloads 20 exports 32 dependencies

Last updated from:75774e9579 (on main). Checks:10 OK. Indexed: no.

TargetResultTimeFilesSyslog
linux-develOK176
pkgdown docsOK229
source / vignettesOK293
linux-releaseOK178
macos-releaseOK137
macos-oldrelOK124
windows-develOK105
windows-releaseOK98
windows-oldrelOK130
wasm-releaseOK130

Exports:cie_comorbidcie_describecie_expandcie_guia_busquedacie_guidecie_lookupcie_map_comorbidcie_normcie_normalizarcie_normalizecie_searchcie_shortcie_siglascie_tablecie_validate_vectorcie10_clear_cachecie10_disconnectcie10_sqlcie11_searchget_icd_api_key

Dependencies:askpassbitbit64blobcachemclicpp11curlDBIdplyrfastmapgenericsgluehttr2lifecyclemagrittrmemoiseopensslpillarpkgconfigR6rlangRSQLitestringdiststringistringrsystibbletidyselectutf8vctrswithr

Guía de Instalación y Configuración
Instalación | Desde CRAN (versión estable) | Desde GitHub (versión de desarrollo) | Dependencias por funcionalidad | Requisitos del sistema | Windows | macOS | Linux (Ubuntu/Debian) | Linux (Fedora/RHEL/CentOS) | Configuración de la API CIE-11 (opcional) | Paso 1: Obtener credenciales | Paso 2: Guardar las credenciales | Paso 3: Verificar la configuración | Caché SQLite | Verificar la instalación | Problemas comunes | Error: "package 'ciecl' is not available" | Error de compilación en Linux | La API CIE-11 no responde | Caché corrupto | Soporte
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Last update: 2026-09-22
Started: 2026-01-19

Installation and Configuration Guide
Installation | From CRAN (stable version) | From GitHub (development version) | Dependencies by feature | System requirements | Windows | macOS | Linux (Ubuntu/Debian) | Linux (Fedora/RHEL/CentOS) | ICD-11 API Configuration (optional) | Step 1: Get credentials | Step 2: Store the credentials | Step 3: Verify the configuration | SQLite cache | Verify the installation | Troubleshooting | Error: "package 'ciecl' is not available" | Compilation error on Linux | The ICD-11 API does not respond | Corrupt cache | Support
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Last update: 2026-09-22
Started: 2026-04-27

Introducción a ciecl: CIE-10 Chile en R
El problema: codificar diagnósticos en Chile | Instalación | Consultas SQL directas al catálogo | Búsqueda por código conocido | Obtener descripciones para reportes | Búsqueda por texto con tolerancia a errores | Comorbilidades de Charlson y Elixhauser | Tablas formateadas para publicación | Fuente de datos oficial | Colaboración y Soporte
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Last update: 2026-09-22
Started: 2026-04-04

Introduction to ciecl: Chilean ICD-10 in R
The problem: working with Chilean diagnostic codes in R | Installation | Direct SQL queries against the catalog | Looking up known codes | Extracting descriptions for use in tables and plots | Fuzzy search with tolerance for misspellings | Charlson and Elixhauser comorbidity indices | Formatted tables with gt | Data source | Collaboration and Support
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Last update: 2026-09-22
Started: 2026-01-17

Getting started with ciecl: a hospital discharge report
Who is this guide for? | The data: DEIS hospital discharges | Step 1: Normalize codes with cie_norm() | Step 2: Add the official descriptions with cie_describe() | Step 3: Find codes when you don't know the code with cie_search() | When a search returns no results | Step 4: Stratify risk with cie_comorbid() | Workflow summary | Next steps
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Last update: 2026-08-28
Started: 2026-04-27

Primeros pasos con ciecl: un reporte de egresos hospitalarios
¿Para quién es esta guía? | Los datos: egresos hospitalarios del DEIS | Paso 1: Normalizar los códigos con cie_norm() | Paso 2: Agregar las descripciones oficiales con cie_describe() | Paso 3: Encontrar códigos cuando no sabes el código con cie_search() | Cuando la búsqueda no entrega resultados | Paso 4: Estratificar riesgo con cie_comorbid() | Resumen del flujo | Para seguir aprendiendo
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Last update: 2026-08-28
Started: 2025-12-14

Language support and internationalization
Supported languages | The Chilean ICD-10 dataset | Features of Chilean Spanish | Accent- and ñ-tolerant search | Chilean medical abbreviations | Multilingual ICD-11 API | Encoding and special characters | References
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Last update: 2026-08-28
Started: 2026-08-28

Soporte de idiomas e internacionalización
Idiomas soportados | Dataset CIE-10 Chile | Características del español chileno | Búsqueda tolerante a tildes y eñes | Siglas médicas chilenas | API CIE-11 multilingüe | Encoding y caracteres especiales | Referencias
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Last update: 2026-06-18
Started: 2026-01-19